En Honduras, los sistemas de salud se han visto en la obligación y necesidad de establecer mecanismos de vigilancia con el objetivo de conocer procesos de salud y enfermedad en la población. El objetivo del artículo es describir el proceso de análisis y las estrategias utilizadas durante el desarrollo de un sistema de información robusto para vigilar la seguridad de las vacunas, el cual también se puede replicar con otras vigilancias. Con este fin, se utilizan metodologías ágiles de desarrollo y herramientas de código abierto, se configura y desarrolla un sistema base de vigilancia, y se incorporan estándares reconocidos para la codificación, la validación y la verificación de la información. Se logró la implementación de un sistema de información confiable, estable y escalable que se utilizará para la vigilancia de eventos supuestamente atribuibles a la vacunación e inmunización (ESAVI) y eventos adversos de especial interés (EVADIE), el cual permitirá la captura oportuna y ágil de los datos de vigilancia y facilitará las tareas de análisis de datos.