La equinococosis quística es endémica e hiperendémica en Uruguay. El objetivo de este estudio fue determinar la especie y el genotipo de Echinococcus granulosus sensu lato en pacientes sintomáticos con equinococosis quística que fueron sometidos a cirugía, además de la localización y estadio de los quistes. En el estudio participaron 13 pacientes de entre 6 y 57 años. Las muestras de quistes de estos casos se analizaron mediante la extracción de ADN, la amplificación de la reacción en cadena de la polimerasa y la secuenciación. Los resultados revelaron la presencia de E. granulosus sensu stricto en todos los casos, con 12 muestras pertenecientes al genotipo G1 y 1 muestra de genotipo G3, lo que sugiere que la persistencia de la enfermedad podría estar relacionada con el ciclo perro/ovinos. Sin embargo, otros huéspedes intermedios, como el ganado, también podrían estar involucrados. Los quistes se encontraron con mayor frecuencia en el hígado, seguido por los músculos y otros sitios (por ejemplo, quistes pulmonares, vertebrales, pélvicos y cardíacos); y el estadio más frecuente fue CE1, seguido por CE2 y CE3b. Tres de los casos ocurrieron en niños o adolescentes, lo que sugiere un ciclo activo de parásitos al menos en algunas áreas del país. Dado que existe una considerable diversidad de especies y genotipos de E. granulosus sensu lato en América del Sur, es importante continuar con este estudio para extraer conclusiones epidemiológicas más sólidas
